13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1689 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1689  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
452 aa  876    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1505  hypothetical protein  32.94 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.335604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 
449 aa  163  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  28.71 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 
449 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 
449 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02808  hypothetical protein  29.51 
 
 
355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000016091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0713  polysaccharide biosynthesis protein  29.91 
 
 
355 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6369  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 
429 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2493  polysaccharide biosynthesis protein  33.77 
 
 
436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0697139  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  19.27 
 
 
477 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>