34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0842 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  176  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  67.11 
 
 
357 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  63.89 
 
 
364 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  57.14 
 
 
365 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  60.27 
 
 
356 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  57.14 
 
 
363 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  58.11 
 
 
362 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  61.84 
 
 
353 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  61.33 
 
 
355 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  57.89 
 
 
363 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  57.89 
 
 
363 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  60 
 
 
351 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  57.89 
 
 
361 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  55.26 
 
 
370 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  57.89 
 
 
375 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  61.84 
 
 
356 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  54.05 
 
 
347 aa  90.9  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  61.84 
 
 
356 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  61.84 
 
 
356 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  55.84 
 
 
374 aa  90.5  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  57.14 
 
 
426 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  55.84 
 
 
357 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  57.14 
 
 
356 aa  87.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  56.58 
 
 
354 aa  83.6  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  51.32 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  51.32 
 
 
362 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  48.05 
 
 
380 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  51.95 
 
 
378 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  52.05 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  73.33 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  39.44 
 
 
387 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  48 
 
 
360 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  40.58 
 
 
395 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  48.08 
 
 
349 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>