299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0017 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4329  tRNA-Lys  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0043  tRNA-Lys  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0503955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0042  tRNA-Lys  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0001  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.46268e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0037  tRNA-Lys  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0015  tRNA-Lys  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0030  tRNA-Lys  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.981752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1954  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0882  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000531124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0028  tRNA-Lys  94.23 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.903037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  94.23 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0029  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.395178  hitchhiker  0.000010783 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0042  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_778  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t26  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1295  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0019  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00557202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0028  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0066  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00163637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  87.32 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>