16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2670 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  777    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2025  hypothetical protein  78.2 
 
 
399 aa  632  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  76.44 
 
 
399 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  76.44 
 
 
399 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  34.49 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  32.85 
 
 
409 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  32.83 
 
 
401 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0542  hypothetical protein  29.24 
 
 
397 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  30.19 
 
 
446 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  29.41 
 
 
357 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  24.22 
 
 
355 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  30.19 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  25.64 
 
 
367 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  32.95 
 
 
457 aa  46.6  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  29.66 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  25.23 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>