16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2398 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2398  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 108 aa  223  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.460172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4213  anti-sigma-factor antagonist  79.09 
 
 		 114 aa  182  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746918  normal  0.233717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0029  anti-sigma-factor antagonist  77.98 
 
 		 114 aa  179  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0732  anti-sigma-factor antagonist  70 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  32.81 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1622  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0100  hypothetical protein  34.43 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1519  hypothetical protein  45.71 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  31.75 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  31.48 
 
 		 111 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>