18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1519 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1519  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  231  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3805  hypothetical protein  61.61 
 
 
114 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3756  hypothetical protein  61.61 
 
 
114 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0797  hypothetical protein  55.45 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0825  hypothetical protein  55.45 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2803  hypothetical protein  50.89 
 
 
117 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0100  hypothetical protein  51.79 
 
 
114 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0808  hypothetical protein  53.1 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1597  hypothetical protein  44.14 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156174  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6727  hypothetical protein  38.6 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3429  hypothetical protein  37.72 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379569  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3678  hypothetical protein  38.6 
 
 
117 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  hitchhiker  0.00469689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2645  hypothetical protein  40.71 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2306  hypothetical protein  40.71 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0023  hypothetical protein  29.66 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.807557  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  41.94 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0047  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2398  anti-sigma-factor antagonist  45.71 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.460172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>