23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0793 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1649    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  59.16 
 
 
821 aa  937    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  59.85 
 
 
828 aa  959    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  30.9 
 
 
812 aa  326  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  31.75 
 
 
818 aa  316  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  31.65 
 
 
819 aa  316  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3330  hypothetical protein  28.91 
 
 
783 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0454731  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  27.39 
 
 
766 aa  172  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2791  hypothetical protein  27.26 
 
 
806 aa  170  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  25 
 
 
889 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  34.48 
 
 
681 aa  74.3  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  24.03 
 
 
692 aa  71.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2591  hypothetical protein  38.75 
 
 
106 aa  50.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000151493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  26.44 
 
 
290 aa  47  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  25.27 
 
 
1079 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  27.64 
 
 
283 aa  45.8  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  22.76 
 
 
296 aa  45.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  22.76 
 
 
296 aa  45.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  22.76 
 
 
296 aa  45.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  21.95 
 
 
287 aa  44.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  32.89 
 
 
248 aa  45.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  25.41 
 
 
286 aa  44.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  24.83 
 
 
288 aa  44.3  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>