More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t35 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t35  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0031  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000756856  normal  0.859731 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0419796  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 1431 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.153905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0038  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000191641  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  95 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.03 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.03 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.03 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  94.03 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  94.03 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0062  tRNA-Met  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0560501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26130  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.15 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  96.15 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.15 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.15 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  96.15 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.15 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.15 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  96.15 
 
 		 80 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  96.15 
 
 		 79 bp  87.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  92.54 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  92.54 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  92.54 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  92.54 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  92.54 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  92.54 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96 
 
 		 80 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000174152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000104946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  93.1 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0026  tRNA-Met  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000815309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  92.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  94.23 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  94.23 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>