49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1070 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  74.22 
 
 
291 aa  461  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  72.13 
 
 
291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  70.73 
 
 
291 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  71.43 
 
 
291 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  62.02 
 
 
285 aa  377  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  64.47 
 
 
291 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  51.11 
 
 
293 aa  271  8.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  49.25 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  50.74 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  49.08 
 
 
284 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  49.08 
 
 
284 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.21 
 
 
300 aa  263  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.3 
 
 
289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  48.18 
 
 
291 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.99 
 
 
293 aa  248  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  49.13 
 
 
297 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  43.53 
 
 
293 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.44 
 
 
292 aa  202  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  36.76 
 
 
287 aa  192  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  32.35 
 
 
299 aa  143  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  31.99 
 
 
299 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  31.65 
 
 
297 aa  136  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  32.1 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  30.47 
 
 
290 aa  112  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.57 
 
 
358 aa  95.9  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  32.65 
 
 
374 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.62 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.15 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  27.69 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.36 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  26.32 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  26.4 
 
 
368 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  26.87 
 
 
365 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  28.49 
 
 
383 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.02 
 
 
396 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  25.13 
 
 
387 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  21.2 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.6 
 
 
401 aa  55.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.94 
 
 
399 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.69 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  23.73 
 
 
371 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.33 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.53 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  33.82 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  24.06 
 
 
376 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.56 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.89 
 
 
234 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  25.28 
 
 
372 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>