19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1036 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1036  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1041  hypothetical protein  78.12 
 
 
96 aa  149  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0438582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0233  hypothetical protein  80.26 
 
 
96 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1358  hypothetical protein  59.38 
 
 
96 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00276911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0912  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000551674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1423  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.257693 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0890  hypothetical protein  53.12 
 
 
100 aa  107  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1978  hypothetical protein  37.89 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2725  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.229625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2742  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1634  uncharacterized conserved coiled coil protein  36.84 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.277027  hitchhiker  0.000011852 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0835  hypothetical protein  44.21 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1933  hypothetical protein  31.87 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0475181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2036  hypothetical protein  36.84 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0429  uncharacterized conserved coiled coil protein  35.44 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2355  hypothetical protein  35.79 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320498  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0719  hypothetical protein  29.47 
 
 
95 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  35.53 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2820  hypothetical protein  32.98 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>