27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0902 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0902  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1360  putative signal transduction protein with CBS domains  44.78 
 
 
229 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1257  putative signal transduction protein with CBS domains  45.45 
 
 
230 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00289092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1331  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 
229 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.576096  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1018  hypothetical protein  38.53 
 
 
230 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1323  putative signal transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
227 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1043  putative signal transduction protein with CBS domains  34.07 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000177571  hitchhiker  0.0000212984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  25.58 
 
 
220 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  27.74 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  26.02 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  25.4 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  23.72 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  24.75 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0657  CBS domain containing protein  24.17 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  24.75 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  24.75 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  24.75 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  24.75 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  24.75 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  24.75 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  24.75 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  24.75 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  24.75 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  25 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1550  CBS domain-containing protein  20.2 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.241797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  24.04 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>