16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8808 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  30.77 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  27.98 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  30.6 
 
 
700 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  41.67 
 
 
331 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  31.11 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  30.77 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  28.07 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  28.3 
 
 
263 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  30.89 
 
 
467 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  27.87 
 
 
263 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  24.55 
 
 
274 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  22.17 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  25 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  21.47 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  33.14 
 
 
429 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>