21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8506 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  740    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  25.96 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  27.85 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  25.61 
 
 
439 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  25.43 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  28.74 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  23.38 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  24.69 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  29.04 
 
 
439 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  29.82 
 
 
339 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  33.98 
 
 
418 aa  53.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  31.72 
 
 
427 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  26.18 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  35.14 
 
 
440 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  25.82 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  36.92 
 
 
457 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  32.93 
 
 
525 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  21.52 
 
 
428 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  25.35 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  29.73 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  27.3 
 
 
386 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>