29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7830 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7830  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
380 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5034  aminoglycoside phosphotransferase  43.3 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.956259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3846  aminoglycoside phosphotransferase  42.23 
 
 
396 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.646827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4687  aminoglycoside phosphotransferase  42.23 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.240401  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3676  aminoglycoside phosphotransferase  42.23 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782987  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2434  aminoglycoside phosphotransferase  42.51 
 
 
396 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724422  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5422  aminoglycoside phosphotransferase  41.34 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0508095  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3578  aminoglycoside phosphotransferase  40.22 
 
 
396 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119492  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02691  aminoglycoside phosphotransferase  41.21 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0151  aminoglycoside phosphotransferase  38.33 
 
 
374 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1323  homoserine kinase  27.11 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.844866  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2288  homoserine kinase  25.64 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1928  homoserine kinase  26.03 
 
 
324 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.0173488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  25.22 
 
 
316 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0361  homoserine kinase  23.62 
 
 
319 aa  49.7  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  27.35 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  24.33 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3320  homoserine kinase  25.11 
 
 
316 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0613669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1060  homoserine kinase  25.94 
 
 
328 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2672  homoserine kinase  25.11 
 
 
316 aa  47  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  28.69 
 
 
321 aa  46.6  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00650  homoserine kinase  29.55 
 
 
316 aa  46.6  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.362782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  27.17 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0152  homoserine kinase  27.46 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  24.57 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5327  homoserine kinase  25.75 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  24.35 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0714  aminoglycoside phosphotransferase  24.36 
 
 
334 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>