25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4175 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  214  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  73.39 
 
 		 109 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  73.83 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  65.42 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  64.22 
 
 		 111 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1105  hypothetical protein  62.26 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1024  hypothetical protein  61.32 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  56.88 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3189  hypothetical protein  56.86 
 
 		 55 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  34.09 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  34.09 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  34.71 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  36.07 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2964  hypothetical protein  35.25 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529567  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0112  hypothetical protein  40.24 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  34.43 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3262  hypothetical protein  51.06 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0507  hypothetical protein  55.56 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.508219  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0071  hypothetical protein  38.67 
 
 		 176 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6780  hypothetical protein  51.11 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4990  hypothetical protein  41.77 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.604608  normal  0.264456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4414  hypothetical protein  55.81 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3948  hypothetical protein  44.29 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>