15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1089 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  64.83 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  61.9 
 
 		 167 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  60.26 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  60.93 
 
 		 155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  60.14 
 
 		 239 aa  193  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  60.14 
 
 		 239 aa  192  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  62.07 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.58 
 
 		 294 aa  169  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  48.65 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 		 316 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  25.52 
 
 		 314 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4098  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  31.68 
 
 		 319 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  25.5 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6488  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  29.31 
 
 		 330 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>