59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3885 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  326  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  42.86 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3321  amino acid-binding ACT  38.18 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40 
 
 		 172 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  34.94 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  33.73 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4094  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.73 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  31.93 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.72 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  30.12 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  31.93 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1356  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.74 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1433  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.67 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1407  ACT domain-containing protein  31.29 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.222833  normal  0.039362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0385  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.12 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000250758  normal  0.230246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  32.14 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.93 
 
 		 173 aa  90.5  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2561  ACT domain-containing protein  31.14 
 
 		 166 aa  90.5  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2735  ACT domain-containing protein  31.14 
 
 		 166 aa  90.5  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  33.91 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1532  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.76 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0236669  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1537  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.76 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1565  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.76 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2628  ACT domain-containing protein  31.14 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2819  amino acid-binding ACT domain protein  31.76 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1697  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.09 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.54674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3169  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.3 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.765517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0383  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.31 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000019763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0357  ACT domain-containing protein  28.31 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000156308  normal  0.422502 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  30.06 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1722  ACT domain-containing protein  29.45 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1500  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.58 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000613254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1273  amino acid-binding ACT domain protein  30.67 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  32.73 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.59 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2585  amino acid-binding ACT  30.49 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2746  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.91 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.989316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  26.06 
 
 		 385 aa  70.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02738  hypothetical protein  25.31 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3675  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  22.5 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  27.22 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45408  predicted protein  25.73 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2884  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  21.76 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3434  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  25 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0869  hypothetical protein  21.95 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00598997  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003104  glycine cleavage system regulatory protein  22.84 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00303201  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42571  predicted protein  25.14 
 
 		 1319 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0052  glycine cleavage system transcriptional repressor  25.53 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.824677  normal  0.630988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.84 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92913  predicted protein  22.35 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00941527  normal  0.3672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3623  glycine cleavage system regulatory protein-like protein  23.46 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.38 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  24.24 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2546  hypothetical protein  22.02 
 
 		 175 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  25 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.22 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  23.6 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  36.67 
 
 		 307 aa  41.2  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0412  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.38 
 
 		 733 aa  40.8  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.563728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>