29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2609 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2609  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0047  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000840593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0089  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.62711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA20  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0493048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09070  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0246462 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0025  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692455  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0033  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0030    96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0163482  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0040  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.312824  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0037  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330229  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0040  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna31  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0021  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0691598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0049  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0541281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0049  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.925267  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>