29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1565 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  98 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1565  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  72 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  53.19 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  50 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  50 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  47.83 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  48 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  44.9 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  43.48 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.22 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  43.48 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0092  ybaK/ebsC protein  44.68 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  44.44 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  44 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  46 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  44 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  44 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  44 
 
 		 158 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  42.22 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  44 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  44 
 
 		 158 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  38 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  44 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  42 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  42 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  42 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>