More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0675 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
333 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  98.5 
 
 
333 aa  653    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  63.36 
 
 
331 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.866173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  62.35 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1033  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  59.35 
 
 
337 aa  403  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1447  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.89 
 
 
341 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.79 
 
 
346 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.59 
 
 
340 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.85 
 
 
346 aa  362  4e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2911  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
350 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.59 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
350 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.111788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.83 
 
 
379 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.97 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.45 
 
 
359 aa  352  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.25 
 
 
350 aa  351  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.63 
 
 
346 aa  351  8.999999999999999e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
351 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.29 
 
 
346 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.25 
 
 
346 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.55 
 
 
348 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.68 
 
 
346 aa  348  9e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1761  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.68 
 
 
350 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3267  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.75 
 
 
351 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3469  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.67 
 
 
341 aa  347  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.99 
 
 
346 aa  347  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.71 
 
 
345 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1248  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.29 
 
 
340 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00288462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.82 
 
 
345 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
345 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.29 
 
 
345 aa  345  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.19 
 
 
345 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.19 
 
 
345 aa  345  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.19 
 
 
352 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.88 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.78 
 
 
348 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.15 
 
 
354 aa  344  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.69 
 
 
350 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.6 
 
 
346 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.21 
 
 
345 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.17 
 
 
348 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.61 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.45 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.6 
 
 
345 aa  342  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
351 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113914  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.29 
 
 
345 aa  342  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0680  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.95 
 
 
351 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
345 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.61 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  50.61 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.12 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0277  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
351 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
351 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
351 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.95 
 
 
351 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.78 
 
 
348 aa  342  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0655  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.95 
 
 
351 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.6 
 
 
345 aa  341  8e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.1 
 
 
347 aa  341  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.12 
 
 
345 aa  341  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.75 
 
 
350 aa  341  8e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.91 
 
 
345 aa  341  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
363 aa  341  9e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.1 
 
 
347 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3848  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.65 
 
 
351 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375893  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.1 
 
 
347 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.2 
 
 
352 aa  340  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.9 
 
 
363 aa  340  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.06 
 
 
346 aa  340  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.67 
 
 
345 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.67 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3566  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.79 
 
 
346 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.8 
 
 
347 aa  339  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.35 
 
 
351 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.693195  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.29 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.39 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.57 
 
 
348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.54 
 
 
352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.98 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
345 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
345 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.3 
 
 
345 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>