19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00390 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00390  sodium-hydrogen antiporter  100 
 
 
533 aa  1055    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08100  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  29.61 
 
 
583 aa  193  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0169724 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08962  sodium ion/proton exchanger, putative (Eurofung)  35.29 
 
 
211 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.369284  normal  0.887642 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44889  predicted protein  30.86 
 
 
892 aa  64.3  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423509  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  29.84 
 
 
806 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
389 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  25.88 
 
 
375 aa  52.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.77 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
385 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  24.6 
 
 
397 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 
392 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 
392 aa  47  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  32.37 
 
 
320 aa  45.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  24.67 
 
 
388 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  24.67 
 
 
388 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  23.26 
 
 
352 aa  43.9  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 
404 aa  43.5  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>