17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02670 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF02670  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 501 aa  1030    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.797192  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03579  Golgi apparatus membrane protein tvp38 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B7A1]  26.1 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131419  normal  0.956877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.33 
 
 		 704 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  23.67 
 
 		 266 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.15 
 
 		 722 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.49 
 
 		 722 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  26.47 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.68 
 
 		 717 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  24.14 
 
 		 713 aa  47.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  26.05 
 
 		 717 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  26.52 
 
 		 738 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  24.81 
 
 		 716 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.59 
 
 		 746 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43839  predicted protein  21.07 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416143  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01720  expressed protein  23.16 
 
 		 345 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  25.5 
 
 		 225 aa  43.9  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 716 aa  43.5  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>