35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND06410 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND06410  vacuole protein, putative  100 
 
 
644 aa  1333    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10934  DHHC zinc finger membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16480)  34.38 
 
 
529 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.199799  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50433  predicted protein  31.34 
 
 
331 aa  99.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34299  predicted protein  32.34 
 
 
300 aa  92.8  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.203748 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42854  predicted protein  60 
 
 
768 aa  92.8  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652023  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00800  vacuole protein, putative  30.09 
 
 
403 aa  90.5  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.714607  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84430  predicted protein  38.39 
 
 
400 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02740  vacuole protein, putative  52.38 
 
 
420 aa  90.5  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18132  predicted protein  27 
 
 
377 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29541  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34596  predicted protein  33.1 
 
 
399 aa  83.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.261571 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9699  predicted protein  66.67 
 
 
50 aa  82.8  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00227125  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48525  predicted protein  46.48 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04763  DHHC zinc finger membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06470)  40.85 
 
 
565 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.165765  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04190  palmitoyltransferase, putative  35.62 
 
 
776 aa  81.6  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01565  Palmitoyltransferase pfa4 (EC 2.3.1.-)(Protein fatty acyltransferase 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD15]  50.85 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0604131  normal  0.184539 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28008  predicted protein  33.79 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.133273 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15768  predicted protein  29.03 
 
 
187 aa  79  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48656  predicted protein  47.76 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45411  predicted protein  41.76 
 
 
406 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268289  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04697  Palmitoyltransferase pfa5 (EC 2.3.1.-)(Protein fatty acyltransferase 5) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B433]  47.89 
 
 
486 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05824  Palmitoyltransferase akr1 (EC 2.3.1.-)(Ankyrin repeat-containing protein akr1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0V6]  30.82 
 
 
737 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04690  conserved hypothetical protein  29.86 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.573007  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32827  predicted protein  28.45 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38073  predicted protein  50.98 
 
 
52 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.683415  normal  0.745145 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10632  predicted protein  54.35 
 
 
53 aa  66.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233358  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90672  Heme Binding Zinc finger protein  48.98 
 
 
363 aa  66.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26089  predicted protein  27.96 
 
 
261 aa  64.3  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00734889 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46123  predicted protein  42.53 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01907  Palmitoyltransferase swf1 (EC 2.3.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BC23]  33.33 
 
 
412 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183278  normal  0.703803 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17764  predicted protein  29.08 
 
 
373 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000195954  normal  0.0112396 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10631  predicted protein  42.55 
 
 
58 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46802  predicted protein  25.34 
 
 
579 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1452  predicted protein  39.62 
 
 
493 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0338335  normal  0.137357 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33443  predicted protein  23.19 
 
 
437 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.137532  normal  0.0676408 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03040  expressed protein  40.82 
 
 
471 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>