35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90672 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_90672  Heme Binding Zinc finger protein  100 
 
 
363 aa  744    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.491736 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01907  Palmitoyltransferase swf1 (EC 2.3.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BC23]  28.83 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183278  normal  0.703803 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34299  predicted protein  40.62 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.203748 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18132  predicted protein  52.38 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29541  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17764  predicted protein  25.78 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000195954  normal  0.0112396 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10934  DHHC zinc finger membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16480)  35.82 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.199799  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84430  predicted protein  25.57 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50433  predicted protein  40.79 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48525  predicted protein  34.19 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48656  predicted protein  34.48 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32827  predicted protein  45.45 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04190  palmitoyltransferase, putative  40 
 
 
776 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02740  vacuole protein, putative  32.54 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45411  predicted protein  35.96 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268289  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42854  predicted protein  50 
 
 
768 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652023  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15768  predicted protein  32.85 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04763  DHHC zinc finger membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06470)  52 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.165765  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00800  vacuole protein, putative  47.06 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.714607  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26089  predicted protein  28.97 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00734889 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01565  Palmitoyltransferase pfa4 (EC 2.3.1.-)(Protein fatty acyltransferase 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD15]  29.94 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0604131  normal  0.184539 
 
 
-
 
NC_006686  CND06410  vacuole protein, putative  48.98 
 
 
644 aa  66.2  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34596  predicted protein  29.93 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.261571 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05824  Palmitoyltransferase akr1 (EC 2.3.1.-)(Ankyrin repeat-containing protein akr1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0V6]  29.01 
 
 
737 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10631  predicted protein  48.94 
 
 
58 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38073  predicted protein  46 
 
 
52 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.683415  normal  0.745145 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1452  predicted protein  26.4 
 
 
493 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0338335  normal  0.137357 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28008  predicted protein  26.06 
 
 
339 aa  59.7  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.133273 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46123  predicted protein  30.25 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_4634  predicted protein  38.64 
 
 
196 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.421921  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10632  predicted protein  48.89 
 
 
53 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233358  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9699  predicted protein  45.45 
 
 
50 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00227125  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46802  predicted protein  36.51 
 
 
579 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04690  conserved hypothetical protein  39.22 
 
 
456 aa  52.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.573007  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03040  expressed protein  36.84 
 
 
471 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04697  Palmitoyltransferase pfa5 (EC 2.3.1.-)(Protein fatty acyltransferase 5) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B433]  33.33 
 
 
486 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>