47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3749 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  759    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  44.64 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  41.02 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  42.38 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  39.38 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  39.55 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  37.23 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  41.67 
 
 		 357 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  41.67 
 
 		 357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  40.8 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  38.9 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  38.22 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  40 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  38.01 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  33.63 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  30.34 
 
 		 369 aa  209  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  34.62 
 
 		 357 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  28.21 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  26.67 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  27.25 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  33.49 
 
 		 541 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  25.36 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  25.36 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  32.57 
 
 		 541 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  24.42 
 
 		 385 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  21.76 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  27.49 
 
 		 996 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1144 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1187 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  20.29 
 
 		 1124 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1169 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1200 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1281 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1235 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  26.67 
 
 		 1235 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1041 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  21.36 
 
 		 981 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1189 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  18.55 
 
 		 595 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  23.56 
 
 		 1261 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1040 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1354 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1181 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  22.75 
 
 		 1275 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1128 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1024 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  24.4 
 
 		 1216 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>