25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3578 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  42.05 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  42.35 
 
 		 288 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  39.07 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  34.51 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  35.32 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  33.96 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.08 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  30.77 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.07 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  28.81 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  30.52 
 
 		 642 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  26.7 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  29.82 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  29.36 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.93 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  29.49 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  29.49 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.5 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.5 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.17 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  24.76 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.03 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2463  periplasmic ATP/GTP-binding protein  24.46 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  26.57 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>