37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1077 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1077  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1369  WbqC-like family protein  39.34 
 
 
217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  40.31 
 
 
221 aa  141  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1999  hypothetical protein  33.81 
 
 
212 aa  132  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0458  hypothetical protein  44.61 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0464  hypothetical protein  44.61 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6224  WbqC-like family protein  33.65 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2171  WbqC-like family protein  36.55 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  35.83 
 
 
204 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07090  hypothetical protein  32.65 
 
 
206 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1809  WbqC-like family protein  31.71 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  25.79 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  23.79 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  23.79 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  28.21 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  32.61 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  26.96 
 
 
246 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  24.22 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  24.88 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  26.22 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  25 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  22.22 
 
 
240 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0322  hypothetical protein  34.09 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0723806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  25.64 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1307  hypothetical protein  23.79 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.760203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  23.53 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  21.71 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  24.32 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  22.63 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  25.5 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  30.95 
 
 
233 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  28.43 
 
 
233 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  24.76 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  27.75 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  23.15 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  19.8 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  23.18 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>