19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0928 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  100 
 
 
655 aa  1283    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1887  hypothetical protein  40.63 
 
 
849 aa  473  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1090  hypothetical protein  37.76 
 
 
821 aa  426  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1133  hypothetical protein  38.54 
 
 
856 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0819  hypothetical protein  30.53 
 
 
856 aa  300  5e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  28.37 
 
 
853 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  28.4 
 
 
856 aa  282  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  28.25 
 
 
843 aa  281  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1400  hypothetical protein  27.95 
 
 
843 aa  277  5e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.71275  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  27.3 
 
 
921 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  26.52 
 
 
1104 aa  61.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.36 
 
 
1061 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  25.79 
 
 
1094 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  26.63 
 
 
1061 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  25.64 
 
 
1079 aa  58.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  22.28 
 
 
1070 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  26.96 
 
 
1144 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  23.48 
 
 
1080 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  24.88 
 
 
1102 aa  50.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>