47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1276 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  76.24 
 
 		 287 aa  442  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.95 
 
 		 289 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  55.07 
 
 		 295 aa  301  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  52.14 
 
 		 284 aa  301  9e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  54.96 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  54.96 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  54.51 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.25 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  51.61 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  52.84 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  53.9 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  50 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.18 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.18 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.71 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  52.33 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  48.56 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  51.58 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  50.97 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.07 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.07 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.65 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  45 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  45 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  45 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  45 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  45 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  45 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  45 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  45 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.8 
 
 		 290 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.79 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  50.35 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  47.16 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  49.64 
 
 		 286 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  49.28 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  45.68 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.48 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.48 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.12 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.12 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  46.53 
 
 		 292 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  38.11 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  23.79 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  31.03 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>