41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10458 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10458  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  625  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  60 
 
 
301 aa  394  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  25.12 
 
 
406 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  24.4 
 
 
638 aa  53.5  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  23.51 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  24.88 
 
 
422 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  26.61 
 
 
332 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  25.36 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  23.9 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  21.94 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  25.33 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  21.94 
 
 
370 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  22.45 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  24.88 
 
 
424 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  24.88 
 
 
422 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  25.94 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  24.2 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  23.23 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  24.06 
 
 
357 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  24.06 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  24.06 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  24.06 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  23.36 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  22.69 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  24.06 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  24.06 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  24.06 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  24.06 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  23.47 
 
 
416 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  24.06 
 
 
364 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  24.06 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  25 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  24.06 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  24.06 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  25.84 
 
 
332 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  24.32 
 
 
347 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  19.8 
 
 
343 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  24.06 
 
 
364 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  24.4 
 
 
378 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  21.9 
 
 
381 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  27.15 
 
 
326 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>