34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02760 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02760  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0260  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.29 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1719  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.39 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00014535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0780  hypothetical protein  34.95 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0871  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 135 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  55 
 
 		 136 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  33.71 
 
 		 136 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.25 
 
 		 129 aa  45.4  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 137 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  29.49 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.81 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  28.43 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.33 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  27.38 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.4 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.5 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  29.76 
 
 		 134 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  27.85 
 
 		 134 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0491  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4057  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.58 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000796256  hitchhiker  0.000000255237 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  25 
 
 		 145 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 145 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 		 178 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00127684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.15 
 
 		 134 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  46.15 
 
 		 134 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 140 aa  42  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.49 
 
 		 142 aa  42  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  26.19 
 
 		 154 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  28.43 
 
 		 134 aa  41.6  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>