44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02100 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  343  7e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  39.33 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  39.22 
 
 		 169 aa  114  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  26.67 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  30.67 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  28.99 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  29.51 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  32.14 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  30.07 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  26.71 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  28.4 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  26.98 
 
 		 248 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3405  hypothetical protein  24.38 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  26.67 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  34.29 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  29.82 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  31.4 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  29.03 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  22.53 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_002950  PG0256  CvpA family protein  25.87 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  35.9 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1046  Colicin V production protein  22.52 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  30.28 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  28.21 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  28.57 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  25.71 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  26.92 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  30.53 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  27.07 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  25.58 
 
 		 177 aa  44.3  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  30.15 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  25.58 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  24.1 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  28.46 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  29.69 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  25.98 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  29.51 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  29.51 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  29.51 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  26.43 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  27.82 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  27.17 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  30.51 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  31.72 
 
 		 162 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>