70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1323 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  100 
 
 
343 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  81.27 
 
 
334 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  63.61 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  63.58 
 
 
337 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  63.13 
 
 
337 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  62.99 
 
 
337 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  65.27 
 
 
335 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  63.02 
 
 
336 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  62.09 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  62.09 
 
 
384 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  62.09 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  62.09 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  62.09 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  63.28 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  64.07 
 
 
335 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  63.91 
 
 
336 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  63.91 
 
 
336 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  63.91 
 
 
336 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  63.91 
 
 
336 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  64.48 
 
 
357 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  61.79 
 
 
384 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  63.91 
 
 
357 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  61.79 
 
 
337 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  64.2 
 
 
336 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  63.77 
 
 
335 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  63.47 
 
 
335 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  62.69 
 
 
337 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  63.28 
 
 
337 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  63.58 
 
 
337 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  63.28 
 
 
337 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  63.61 
 
 
336 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  63.17 
 
 
335 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  63.28 
 
 
337 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  63.17 
 
 
335 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  63.17 
 
 
335 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  63.28 
 
 
337 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  63.28 
 
 
337 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  63.28 
 
 
337 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  61.49 
 
 
336 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  60.6 
 
 
336 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  60.6 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  55.75 
 
 
349 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  55.45 
 
 
331 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  54.83 
 
 
331 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  56.07 
 
 
333 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  53.89 
 
 
331 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  55.28 
 
 
332 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  54.83 
 
 
332 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  40.98 
 
 
355 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  37.78 
 
 
339 aa  223  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  38.87 
 
 
346 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  39.53 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  37.46 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  38.46 
 
 
516 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  37.61 
 
 
520 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  40.06 
 
 
406 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  37.38 
 
 
317 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  38.04 
 
 
381 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  37.96 
 
 
360 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  38.24 
 
 
320 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  36.65 
 
 
340 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  35.67 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  37.65 
 
 
336 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  37.65 
 
 
336 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  37.65 
 
 
336 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  37.92 
 
 
383 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  34.99 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  32.39 
 
 
814 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  31.66 
 
 
333 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  38.04 
 
 
222 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>