18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1068 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1068  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  336  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650307  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  67.03 
 
 
351 aa  120  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  67.03 
 
 
351 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  65.93 
 
 
285 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3748  putative transposase  67.03 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4216  hypothetical protein  65.93 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0960652  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4634  hypothetical protein  65.93 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  65.93 
 
 
253 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2483  putative transposase  64.63 
 
 
82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244934  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  64.84 
 
 
351 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  34.15 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  34.15 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  34.15 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  34.15 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  34.15 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  34.15 
 
 
353 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  34.15 
 
 
343 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  35.06 
 
 
356 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>