29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1229 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  80.55 
 
 		 530 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  88.63 
 
 		 554 aa  911    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1098    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  81.57 
 
 		 559 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  67.8 
 
 		 552 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  67.98 
 
 		 559 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  66.17 
 
 		 552 aa  675    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  82.25 
 
 		 551 aa  873    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  81.22 
 
 		 559 aa  854    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  60.44 
 
 		 573 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  59.17 
 
 		 541 aa  581  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  53.74 
 
 		 574 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  52.3 
 
 		 574 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  48.1 
 
 		 586 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  44.52 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  44.23 
 
 		 579 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  42.96 
 
 		 528 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  39.6 
 
 		 499 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  39.31 
 
 		 512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  33.75 
 
 		 568 aa  270  5e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  33.57 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  35.71 
 
 		 548 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  35.37 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  34.68 
 
 		 581 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  35.43 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  39.79 
 
 		 331 aa  194  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  37.89 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  32.02 
 
 		 569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.84 
 
 		 462 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>