More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2367 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
359 aa  706    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  70.43 
 
 
348 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  70.43 
 
 
348 aa  484  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  71.26 
 
 
348 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1772  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  75.15 
 
 
348 aa  481  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  70.8 
 
 
352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.99 
 
 
344 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.72 
 
 
344 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.8 
 
 
349 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.85 
 
 
344 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.85 
 
 
344 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.6 
 
 
344 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.14 
 
 
344 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.31 
 
 
385 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.52 
 
 
349 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.31 
 
 
385 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.85 
 
 
344 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.85 
 
 
344 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.85 
 
 
344 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.85 
 
 
344 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.85 
 
 
344 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.55 
 
 
350 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.09 
 
 
344 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.31 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.83 
 
 
385 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.56 
 
 
344 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  65.31 
 
 
344 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  63.27 
 
 
344 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  64.72 
 
 
344 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  55.72 
 
 
351 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  52.02 
 
 
344 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  51.91 
 
 
340 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22300  ABC transporter related  52.2 
 
 
352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.321678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  52.56 
 
 
354 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 
339 aa  345  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.74 
 
 
356 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.6 
 
 
382 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.59 
 
 
377 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.31 
 
 
339 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  47.31 
 
 
339 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  47.31 
 
 
339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  47.01 
 
 
339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  47.31 
 
 
339 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
339 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
339 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
339 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  54.29 
 
 
388 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
339 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.35 
 
 
335 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  51.03 
 
 
377 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.52 
 
 
368 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  333  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  48.12 
 
 
341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  56.15 
 
 
353 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  47.98 
 
 
342 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  55.81 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  56.48 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
346 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.44 
 
 
343 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  325  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  50.15 
 
 
343 aa  325  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  55.74 
 
 
359 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
343 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  324  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 
397 aa  324  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
341 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  54.97 
 
 
387 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.6 
 
 
335 aa  323  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.87 
 
 
335 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  49.85 
 
 
343 aa  322  7e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 
341 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
346 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0218  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
346 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 
341 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  50.15 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  49.42 
 
 
347 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>