54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5802 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  91.37 
 
 
394 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  77.41 
 
 
394 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  77.41 
 
 
394 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  76.74 
 
 
394 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  78.15 
 
 
392 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  78.15 
 
 
393 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  78.15 
 
 
392 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  76.67 
 
 
395 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  76.09 
 
 
396 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  62.21 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.01 
 
 
386 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  59.8 
 
 
392 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  60.62 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.9 
 
 
395 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  59.79 
 
 
388 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  60.78 
 
 
391 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  62.33 
 
 
378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  60.69 
 
 
386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  58.07 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  59.22 
 
 
399 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  58.76 
 
 
394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  60.05 
 
 
378 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  57.07 
 
 
389 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  58.35 
 
 
397 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  56.19 
 
 
393 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  58.33 
 
 
405 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  58.2 
 
 
405 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  57.03 
 
 
392 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  57.55 
 
 
413 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  55.47 
 
 
380 aa  411  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  55.73 
 
 
380 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  56.46 
 
 
400 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  55.73 
 
 
380 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  55.5 
 
 
400 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  53.73 
 
 
383 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  51.84 
 
 
414 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  68.26 
 
 
242 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  70.59 
 
 
228 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  34.47 
 
 
277 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.42 
 
 
291 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.01 
 
 
278 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.26 
 
 
281 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.33 
 
 
272 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.84 
 
 
288 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.16 
 
 
299 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.55 
 
 
290 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.62 
 
 
278 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.06 
 
 
293 aa  84  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.27 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.93 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.85 
 
 
299 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  31.16 
 
 
259 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  29.01 
 
 
308 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>