15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4047 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0501  hypothetical protein  84.28 
 
 
402 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4047  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3702  hypothetical protein  65.26 
 
 
403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0451  hypothetical protein  50.54 
 
 
377 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1074  hypothetical protein  36.13 
 
 
397 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3187  hypothetical protein  35.62 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2858  hypothetical protein  30.56 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.953596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0116  hypothetical protein  34.03 
 
 
407 aa  196  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000692452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0968  hypothetical protein  32.57 
 
 
385 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2589  hypothetical protein  30.63 
 
 
396 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3747  hypothetical protein  25 
 
 
396 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.652201  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0051  hypothetical protein  25.13 
 
 
399 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000151873  hitchhiker  0.00624496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3430  hypothetical protein  27.02 
 
 
480 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1829  hypothetical protein  24.15 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2870  hypothetical protein  24.11 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>