17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0238 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0474  hypothetical protein  95.3 
 
 		 234 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.772079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6485  hypothetical protein  86.09 
 
 		 230 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.32535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1779  hypothetical protein  70.54 
 
 		 230 aa  304  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2574  hypothetical protein  66.38 
 
 		 230 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  25.11 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  25.55 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4985  hypothetical protein  25.52 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322799  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  28.41 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  28.41 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  24.76 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  28.41 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  26.16 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1733  chromosome partitioning ATPase  31.58 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.635765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.1 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  24.55 
 
 		 241 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  24.55 
 
 		 241 aa  41.6  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>