26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0124 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  61.38 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  62.07 
 
 
153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  56.85 
 
 
150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  54.17 
 
 
146 aa  166  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  48.28 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  49.66 
 
 
144 aa  150  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1282  hypothetical protein  40.21 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00265789  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  32.33 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  30.82 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  29.58 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  29.46 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  29.58 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  29.45 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  31.72 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  29.1 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  28.19 
 
 
298 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  33.79 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  32.59 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  26.21 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  29.17 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  27.07 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  27.7 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  26.19 
 
 
294 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  28.47 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>