35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4640 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4640  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  190  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22404  normal  0.548162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  66.67 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  63.49 
 
 		 405 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.52 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  63.41 
 
 		 403 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5503  YeeE/YedE family protein  60.98 
 
 		 403 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  59.52 
 
 		 404 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.32 
 
 		 407 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  65.85 
 
 		 404 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.14 
 
 		 404 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  65.85 
 
 		 404 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.46 
 
 		 406 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  59.52 
 
 		 406 aa  50.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.76 
 
 		 404 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  57.14 
 
 		 415 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 408 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0018382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2163  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.98 
 
 		 407 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.1 
 
 		 419 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4796  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.66 
 
 		 423 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4340  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.76 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.36823  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4280  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.76 
 
 		 404 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.81 
 
 		 401 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1579  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.86 
 
 		 399 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1397  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.88 
 
 		 375 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2739  hypothetical protein  37.88 
 
 		 375 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.367731  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  60.53 
 
 		 418 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1773  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.36 
 
 		 375 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.458481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  61.76 
 
 		 394 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.26 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  38.78 
 
 		 401 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  38.78 
 
 		 401 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  38.78 
 
 		 401 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  38.78 
 
 		 401 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  38.78 
 
 		 401 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  37.93 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>