36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3555 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
348 aa  681    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  46.94 
 
 
347 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1113  flagellar hook-associated protein FlgL  41.95 
 
 
347 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.406024  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  41.09 
 
 
348 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  39.66 
 
 
348 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  39.66 
 
 
351 aa  245  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  40.57 
 
 
344 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0685  flagellar hook-associated protein FlgL  38.4 
 
 
350 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  35.06 
 
 
349 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0696  flagellar hook-associated protein FlgL  37.25 
 
 
350 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  34.71 
 
 
355 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0659  flagellar hook-associated protein FlgL  38.23 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1705  flagellar hook-associated protein FlgL  35.57 
 
 
351 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.173366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0340  flagellar hook-associated protein FlgL  32.4 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112309  normal  0.583206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0372  flagellar hook-associated protein FlgL  31.56 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  31.04 
 
 
360 aa  161  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0278  flagellar hook-associated protein FlgL  30.48 
 
 
350 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5249  flagellar hook-associated protein FlgL  33.14 
 
 
348 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5529  flagellar hook-associated protein FlgL  33.99 
 
 
348 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0173454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  25.28 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  24.41 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3479  flagellar hook-associated protein FlgL  25.59 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.0673338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  24.65 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0875  flagellar hook-associated protein FlgL  21.63 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  24.82 
 
 
335 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4175  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  24.23 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  25.53 
 
 
597 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  25.53 
 
 
597 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  26.24 
 
 
333 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3169  flagellar hook-associated protein FlgL  21.94 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.247991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  24.11 
 
 
597 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0769  flagellar hook-associated protein FlgL  22.22 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  27.5 
 
 
602 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  23.91 
 
 
535 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  28.35 
 
 
588 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  31.17 
 
 
497 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.337624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>