10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2056 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2056  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  158  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  40.91 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  40.62 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  45.24 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  45.24 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  37.25 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  40.68 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  48.65 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1886  hypothetical protein  36 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2220  hypothetical protein  38.57 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595512  normal  0.241423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>