19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06390  ArsR family regulatory protein  100 
 
 
182 aa  348  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3541  hypothetical protein  47.09 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0530998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  39.05 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1887  transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.040626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6084  regulatory protein ArsR  39.72 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5341  hypothetical protein  38.68 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3321  hypothetical protein  26.6 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.669546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3105  hypothetical protein  26.46 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3351  hypothetical protein  26.46 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2591  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3091  hypothetical protein  26.46 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
111 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
127 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
111 aa  42  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
183 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
111 aa  41.2  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
111 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>