17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6394 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  91.67 
 
 
204 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  91.67 
 
 
204 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  74.88 
 
 
204 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  59.11 
 
 
204 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  54.19 
 
 
204 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  40.19 
 
 
208 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  40.39 
 
 
203 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  40.39 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  38.73 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  34.66 
 
 
203 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  31.76 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  24.58 
 
 
388 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 
317 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  34.31 
 
 
107 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  34.31 
 
 
107 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  31.07 
 
 
104 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>