54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6462 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  82.1 
 
 		 394 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  98.21 
 
 		 393 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  787    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  787    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  79.9 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  78.15 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  78.35 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  78.15 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  78.15 
 
 		 394 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  77.01 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  62.33 
 
 		 378 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  62.72 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  61.01 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.95 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  59.84 
 
 		 388 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  55.93 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  60 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  59.02 
 
 		 399 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  59.49 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  60.47 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  59.14 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  59.14 
 
 		 413 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  58.67 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  58.33 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  56.52 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  58.59 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.84 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  57.29 
 
 		 397 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  55.36 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  55.99 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  56.62 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  55.99 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  56.12 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  55.56 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  54.73 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  53.89 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  52.3 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  68.42 
 
 		 242 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  70.59 
 
 		 228 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.39 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.17 
 
 		 278 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  30.55 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.16 
 
 		 288 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.65 
 
 		 290 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.86 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.84 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.67 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.48 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.7 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.09 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.96 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.03 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  27.9 
 
 		 308 aa  49.7  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  32.43 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.886645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>