17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5521 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  91.67 
 
 		 204 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  74.38 
 
 		 204 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  57.64 
 
 		 204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0549  NIPSNAP  53.2 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  40.19 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  47.37 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2424  NIPSNAP family protein  41.38 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.049725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  41.28 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0413  NIPSNAP domain-containing protein  32.76 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2959  NIPSNAP domain-containing protein  30 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266712  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  36.27 
 
 		 107 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  36.27 
 
 		 107 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  25.14 
 
 		 388 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  22.99 
 
 		 317 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  32.04 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>