62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1162 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  96.21 
 
 
343 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  91.57 
 
 
344 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  88.05 
 
 
341 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  87.46 
 
 
341 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  80.17 
 
 
338 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  46.46 
 
 
341 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  37.01 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  43.38 
 
 
357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  35.54 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  44.67 
 
 
205 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  43.65 
 
 
337 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  44.95 
 
 
337 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  37.54 
 
 
366 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  43.65 
 
 
337 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  38.82 
 
 
343 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  39.26 
 
 
349 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  41.5 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  39.61 
 
 
380 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  36.4 
 
 
366 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  34.7 
 
 
344 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  33.64 
 
 
364 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  41.71 
 
 
400 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  34.77 
 
 
352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  33.04 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  34.12 
 
 
338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  33.45 
 
 
338 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  32.77 
 
 
338 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  32.77 
 
 
338 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  37.62 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  32.67 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  36.99 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  33.78 
 
 
336 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  34.75 
 
 
503 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  35.62 
 
 
315 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  37.17 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  36.82 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  38.43 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  35.86 
 
 
316 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  35.86 
 
 
316 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  33.58 
 
 
316 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  38.42 
 
 
354 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  39.8 
 
 
443 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  35.42 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  34.86 
 
 
925 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  27.88 
 
 
274 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  33.49 
 
 
443 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  32.03 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  26.88 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  29.48 
 
 
195 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  29.38 
 
 
209 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
194 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  27.88 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  28.68 
 
 
224 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  27.88 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  28.3 
 
 
222 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  33.67 
 
 
225 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 
496 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  25.74 
 
 
199 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  30.3 
 
 
842 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>