23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6921 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6921    100 
 
 		 327 bp  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4886  hypothetical protein  100 
 
 		 165 bp  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3278  hypothetical protein  100 
 
 		 165 bp  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0873047 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    81.78 
 
 		 1540 bp  145  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  83.62 
 
 		 1539 bp  121  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6919  hypothetical protein  93.75 
 
 		 288 bp  95.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4888  hypothetical protein  92.19 
 
 		 282 bp  87.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3276  hypothetical protein  92.19 
 
 		 282 bp  87.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0487719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    79.9 
 
 		 1556 bp  81.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  87.34 
 
 		 1539 bp  77.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  80.21 
 
 		 576 bp  77.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  80.23 
 
 		 1548 bp  73.8  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6811    83.65 
 
 		 2852 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  81.12 
 
 		 1602 bp  69.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1167    90.57 
 
 		 225 bp  65.9  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  84.71 
 
 		 1539 bp  65.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5960    94.87 
 
 		 389 bp  61.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  87.3 
 
 		 1647 bp  54  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  90.7 
 
 		 1158 bp  54  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  82.56 
 
 		 1389 bp  52  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1539 bp  50.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1539 bp  50.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 1539 bp  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>