28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4982 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  244  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  96 
 
 
125 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  82.4 
 
 
125 aa  204  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4406  hypothetical protein  81.6 
 
 
125 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4925  hypothetical protein  80.8 
 
 
125 aa  197  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.855297  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2175  hypothetical protein  42.18 
 
 
147 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2082  hypothetical protein  42.31 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50216  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2708  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4453  hypothetical protein  33.05 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3614  hypothetical protein  33.05 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3913  hypothetical protein  33.05 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625508  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0040  hypothetical protein  35.25 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  34.81 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  35.77 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  34.45 
 
 
122 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2317  hypothetical protein  31.25 
 
 
134 aa  43.5  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2845  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0910  hypothetical protein  28.97 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.576139 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1805  hypothetical protein  34.06 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2369  hypothetical protein  34.06 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0476  hypothetical protein  34.06 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195893  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0822  hypothetical protein  34.06 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773892  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0426  hypothetical protein  34.06 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15110  hypothetical protein  33.85 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.225372  hitchhiker  0.000572412 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2508  hypothetical protein  35.82 
 
 
131 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2829  hypothetical protein  30.63 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>